En 2000 Michelle saca su primer trabajo discográfico titulado Broken Bracelet que le sirvió como carta de presentación para luego firmar un contrato con la compañía de discos de Madonna, Maverick Records y sacar su segundo álbum The Spirit Room, en agosto de 2001. En 2002 colabora con la canción Without You para el grupo Justincase y seguido con Carlos Santana graba la canción «The Game Of Love» para su álbum Shaman, ganando el Grammy como mejor colaboración femenina. Ese mismo año se presenta junto a Santana en la primera edición de los Premios MTV Latinoamérica interpretando «The Game of Love» y ganó un premio en los MTV Video Music Awards de ese mismo año.

Para 2003, fue lanzado “Hotel Paper, Los sencillos de su tercer material discográfico fueron «Are You Happy Now?», «Breathe» y ‘Til I Get Over You. Pero estos no son los únicos temas sobresalientes de su tercer trabajo, «Empty Handed» es el tema con mayor carga emocional y psicodélica. A ello ha contribuido el arreglo de cuerda a lo «Sergeant Peppers» oficiado en los estudios Henson, propiedad de David Campbell. Ese mismo año vuelve a ser nominada a los Grammy en las categorías de “Best New Artist” (Mejor Artista Nueva), y “Best Pop Collaboration With Vocals” (Mejor Colaboración Pop).

El 23 de mayo de 2003 se casó a sus casi 20 años con el bajista Teddy Landau en México. Ese mismo año Branch colabora con Will Hoge para el álbum «Blackbird On A Lonely Wire» con la canción «Baby Girl». También participó en el álbum «Peace Songs» con la canción «What the World Needs Now Is Love» (Jackie DeShannon) con artistas como «Chantal Kreviazuk», Avril Lavigne & Celine Dion.

El estilo musical de Michelle es una mezcla de pop con rock y sonidos orgánicos algunos lo catalogan como adult alternative

En 2005 Michelle y Teddy se convierten en los padres de una niña llamada Owen Isabelle. Pero su carrera no queda ahí, ese año graba la canción «Life On Mars» (de David Bowie), para el disco «Gap Favorite Songs: Fall 2005» y a finales de 2005 se corre el rumor de una posible unión musical con su amiga Jessica Harp.

Para 2006 la unión ya era un hecho Michelle y Jessica Harp forman un dúo de country llamado The Wreckers, el disco fue lanzado en ese año, bajo el nombre Stand Still, Look Pretty, el primer sencillo Leave The Pieces se colocó en el primer lugar de las listas de música country en los Estados Unidos y Reino Unido, siguiéndole como segundo sencillo el tema «My, Oh My». Por segunda vez ese año Michelle es invitada por Santana a formar parte de su siguiente trabajo discográfico «All That I Am» con la canción «I’m Feeling You» pero Branch recalcó que ahora no solo era Michelle Branch sino The Wreckers, así que «Harp» participó en la canción y video de la misma, en los coros.

El 4 de diciembre de 2007, sale a la venta «Way Back Home: Live at New York City» su segundo álbum como The Wreckers y su primer álbum en vivo.

Álbumes
Broken Bracelet (2000)
The Spirit Room (2001)
Hotel Paper (2003)
Stand Still, Look Pretty con Jessica Harp (con el nombre de The Wreckers) (2006)
Way Back Home: Live From New York City con Jessica Harp (con el nombre de The Wreckers) (2007)
West Coast Time (2011)
Hopeless Romantic (2017)
EP
Everything Comes and Goes (2010)
The Loud Music Hits (2011)
Sencillos
2001: «Everywhere»
2002: «All You Wanted»
2002: «Goodbye to You»
2002: «The Game of Love» (Santana featuring Michelle Branch)
2003: «Are You Happy Now?»
2003: «Breathe»
2004: «‘Til I Get Over You»
2005: «I’m Feeling You» (Santana featuring Michelle Branch and The Wreckers)
2005: «The Good Kind»
2006: «Leave The Pieces»
2006: «My, Oh My»
2007: «Tennessee»
2007: «Leave The Pieces» (Live)
2009: «This Way»
2009: «Sooner Or Later»
2010: «Getaway» [Feat. Timbaland]
2011: «Loud Music»
2017: «Hopeless Romantic»
2017: «Best You Ever»
2017: «Fault Line»